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常规用量下有20％～30％患者会出现不同程度的咽喉发干、胸部灼热感、头晕、胸闷、气急、厌食。偶见腹痛、腹泻、胆绞痛。服用过量可引起呼吸中枢麻痹，出现呼吸困难、面色苍白，甚则死亡。脾胃虚弱者慎服。
种子繁殖的百部，经2～3年可采收。分株繁殖的百部，2年即可采收。采收时间宜在11月下旬至次年2月间。把全株挖起，将符合规格的大块根从根茎部剪下，洗去泥土，直接在太阳下晒干。也可将洗净的块根放入开水中，煮到水再开时立即捞起（大条者，煮的时间可略长），晒干或烘干。
百部时多年生草本植物，一般需要生长3年百部才会开花结果，在每年秋季7-9月时，它的地上茎叶开始枯萎发黄，而果实也会有绿色变为黄褐色，当种植近暗紫色时即可采摘。而对于后期开花结果的种子都不会成熟，将果实采收后，将其置于通风干燥处晾晒几天，待果实的外壳自然开裂后，种子会自行脱出，这时去除杂质，挑选出种植，晒干储藏备用。
百部适宜在海拔300-400米的地方种植。选择阴凉湿润、土层深厚、肥沃疏松、排水良好的砂质土壤，翻地深33cm左右，拾掉石块、草根，然后起畦作苗床。苗床宽1.3m，高18cm，沟深33cm，耙平畦面待播。
